Zowel CinemaSins als ScreenRant halen de logica van deze gebeurtenis aan in "Everything Wrong With" en "Pitch Meeting". Want is de T-Rex eerder uit het ruim gebroken en is hij, na het opvreten van de crew, er vervolgens weer netjes in gaan zitten en heeft hij de deuren gesloten?
Veel theorieën circuleren rond onder fans. De meest bekende is dat de T-Rex tijdens de reis in een kooi werd getransporteerd (want beneden is een wrak van een kapotte kooi te zien) en nog voordat deze in het ruim was geladen, ontsnapte hij en in een poging hem te vangen, werd de bemanning gedood waarna de T-Rex zichzelf terugtrok in het ruim.
Pteranodons
Een andere leuke theorie betreft een verwijderde scène die de film nooit gehaald heeft met de Pteranodons (de vliegende
Dit verklaart ook beter de afgehakte hand in de stuurhut, want het is onwaarschijnlijk dat de T-Rex erin geslaagd is om zijn kolossale hoofd daarin te steken. Waar de Pteranodons dan uiteindelijk zijn gebleven, is weer een ander verhaal, maar het lijkt niet voor niks dat de gehele sequentie alsnog werd gebruikt voor de opening van Jurassic Park III.