Bij de release van de tweede Matrix-film kunnen fans naar de winkel lopen om daar een nieuwe Special Edition DVD te kopen. Dat wordt dan al de derde dvd-uitgave van The Matrix. Mensen die een van de eerdere twee versies gekocht hebben, zullen zich behoorlijk bekocht voelen als ze zien dat alle extra's van de vorige twee dvd's ook op de nieuwe te vinden zullen zijn. Op de 2-dvd-set dus onder andere de lange documentaire Matrix Unleashed maar toch ook een grote hoeveelheid nieuwe extra's, waaronder nieuwe documentaires, drie uur aan muziek uit de film, een galerij met 800 foto's en een uitgebreide vooruitblik op de tweede en derde film.